Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CSTF3Q12996 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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