Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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