Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PTPRAP18433 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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