Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTIFO43310 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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