Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms