Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms