Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms