Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CITED1Q99966 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms