Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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