Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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