Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Q1T7F1 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Q1T7F1 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Q1T7F1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Q1T7F1 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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