Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
IMPG1Q17R60 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IMPG1Q17R60 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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