Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms