Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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