Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USF2Q15853 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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