Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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ALX1Q15699 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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ALX1Q15699 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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