Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TAF1AQ15573 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms