Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SEC23BQ15437 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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SEC23BQ15437 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SEC23BQ15437 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23BQ15437 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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