Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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