Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms