Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFIXQ14938 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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