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| FHL3 | Q13643 | EIF2S1-202 | ENST00000466499 | 2390 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | KIFAP3-202 | ENST00000367765 | 4111 nt | TSL 2 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | RAG2-209 | ENST00000618712 | 2818 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | PTPRC-201 | ENST00000348564 | 4626 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
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| FHL3 | Q13643 | TBCAP3-201 | ENST00000512475 | 312 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SKP21-201 | ENST00000516503 | 220 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-572P-201 | ENST00000516724 | 80 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-703P-201 | ENST00000516946 | 107 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORA25.17-201 | ENST00000517184 | 124 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AP000462.3-201 | ENST00000545593 | 330 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC046158.1-201 | ENST00000563408 | 719 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPL23AP97-201 | ENST00000568955 | 471 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC100781.1-201 | ENST00000597142 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | FAM27D1-201 | ENST00000612308 | 341 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL589935.1-202 | ENST00000612512 | 393 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | UBE2E2-206 | ENST00000613545 | 282 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC007546.2-201 | ENST00000623996 | 360 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL359313.1-202 | ENST00000635073 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | U6.99-201 | ENST00000637524 | 83 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF382-203 | ENST00000435416 | 3865 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | CDK14-201 | ENST00000265741 | 4953 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | CNTN1-201 | ENST00000347616 | 5507 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| FHL3 | Q13643 | TMEM59-205 | ENST00000371348 | 1911 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF415-207 | ENST00000595193 | 2479 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| FHL3 | Q13643 | EFHC1-205 | ENST00000538167 | 5308 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |