Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PICALMQ13492 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms