Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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