Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
XRCC4Q13426 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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