Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SP140Q13342 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SP140Q13342 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SP140Q13342 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SP140Q13342 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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