Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GPS1Q13098 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms