Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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TRDNQ13061 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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TRDNQ13061 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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