Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NFIAQ12857 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms