Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GTF3C1Q12789 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C1Q12789 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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