Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms