Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms