Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms