Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TTPAP49638 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms