Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPFP49454 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPFP49454 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPFP49454 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPFP49454 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPFP49454 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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CENPFP49454 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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CENPFP49454 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPFP49454 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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