Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPREP23469 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms