Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CCDC47Q96A33 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CCDC47Q96A33 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CCDC47Q96A33 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CCDC47Q96A33 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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