Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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