Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP31Q70CQ4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP31Q70CQ4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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