Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RNF20Q5VTR2 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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