Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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PTPROQ16827 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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PTPROQ16827 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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PTPROQ16827 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPROQ16827 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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