Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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