Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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