Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TAF1CQ15572 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms