Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms