Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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