Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CACNA1CQ13936 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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