Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKP1Q13835 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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