Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms