Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNTA1Q13424 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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